From the GALAXY-project's description in Cordis:

"Alcohol overuse is an important societal challenge with annual healthcare costs of over €22 billion in Europe. Alcohol is the main cause of liver cirrhosis, which is the 5th and 7th most common cause of life years lost in respectively Eastern and Western Europe. Cirrhosis is considered irreversible but its precursor, liver fibrosis, is reversible when detected before disease progression. GALAXY proposes that crosstalk between the gut microbiome and the liver influences the development and progression of alcoholic liver fibrosis. Here, a ‘dysbiotic’ microbiome in susceptible individuals leads to progressive liver fibrosis in combination with alcohol overuse. Therefore, interventions aiming to restore a healthy gut microbiome will reduce disease development. We will use state-of-the-art systems medicine tools to improve understanding of the complex interplay present during alcoholic liver fibrosis, to identify at-risk individuals in time and to develop personalised healthcare strategies for alcohol over-users (20% of the EU population >15 years old). GALAXY brings together partners with unique research competences in clinical hepatology, microbiome, multi-omics, biomarkers and bioinformatics. Our aim is to develop novel systems medicine tools which integrate clinical, multi-omics and lifestyle information from alcohol over-users at various stages of the disease and healthy individuals in order to: 1) identify signatures of host-microbial cross-talk during disease development and progression, 2) translate this into biomarkers for diagnosis, stratification and treatment monitoring in alcohol over users, and 3) evaluate new interventions to modulate gut microbiota towards prevention and mitigation of the disease in at-risk individuals. We will also study societal and economic impact of GALAXY biomarkers and treatments to accelerate future development. The GALAXY consortium includes strong SME partners who will enable the results to be exploited commercially."

http://cordis.europa.eu/project/rcn/199746_en.html

Hvordan kan opbygning af forskningsdokumentation – i henhold til ’best practice’ – gennem hele forskningsprocessen bidrage til at styrke forskerens arbejde samt styrke datadeling mellem forskere, bevaring af forskningsdata, citeringsmuligheder, sammenligning af data over tid mv?

Der vil være særligt fokus på DMP, metadatering, formattering og deling/bevaring af data.

Syddansk Universitetsbibliotek, Dansk Data Arkiv/Rigsarkivet, OPEN Odense Patient data Explorative Network, OUH Odense Universitetshospital/Klinisk Institut, Syddansk Universitet

Digitale data (samlinger) der eksisterer før forskningsprojektet går i gang. Fx samlingens navn

Hvad påtænkes disse data anvendt til ? (uddybende beskrivelse af forskningsspørgsmål  og -mål)

Hvem har ansvaret for disse data?

Er der særlige juridiske forhold? (personfølsomme oplysninger, patenter, ophavsret...)

Hvem kan få adgang til data? (betingelser)

Hvor befinder disse data sig?

Hvor store datamængder tænkes behandlet (fx antal Gb / Tb samt antal objekter/filer)

Hvilke filformater indgår i samlingen? (TEI, JP2, MP3, …)

Hvilke kendte værktøjer tænkes anvendt? (gerne link til værktøjet)

Kræver data/værktøjer specifikt software/system?

Hvad er forholdet mellem eksisterende data og de nye data ? ( Er det afledte data? Skal alle datasæt bevares?)

Hvad påtænkes de nye data anvendt til ? (uddybende beskrivelse af forskningsspørgsmål og tilgangsvinkel)

Hvilke filformater tænkes de nye data at blive lagret i ?

Hvor store mængder nye data er der tale om ? (størrelse og antal objekter/filer)

Har de nye data værdi efter projektets afslutning, således at de bør bevares? (i givet fald hvilken værdi og for hvem)

Hvilke kendte værktøjer tænkes anvendt på de nye data? (gerne link til værktøjet)

Overvejes udvikling af nye værktøjer?